Após 35 rodadas oscilando entre a última e a penúltima posição, o Sampaio Corrêa teve seu rebaixamento confirmado para a Série C de 2017. O clube maranhense perdeu por 1 a 0 para o Bahia na cidade Salvador e viu ser sacramentado o seu retorno a Terceira Divisão do Campeonato Brasileiro.
O Sampaio permaneceu por três temporadas na Segunda Divisão do Brasileiro. Em 2015, esteve próximo do acesso, mas perdeu fôlego na reta final. Sem planejamento e instabilidade causada pelo presidente Sérgio Frota.
Na Série C de 2017, o Sampaio vai enfrentar o arquirrival Moto Club, além de ter pela frente outros adversários de peso como Fortaleza, América/RN e Remo/PA.